Η Φαρμακευτική Σχολή του Πανεπιστημίου Comenius της Μπρατισλάβα προσφέρει Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών στη Φαρμακευτική στην Αγγλική γλώσσα και Ph.D. Μεταπτυχιακές σπουδές σε τέσσερις ειδικότητες που σχετίζονται με τη φαρμακευτική σε περίπου 100 διεθνείς φοιτητές. Το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών Φαρμακευτικής (συνδυασμένο πτυχίο Bachelor & Master) εκτείνεται για πέντε χρόνια (10 εξάμηνα). Οδηγεί στο πτυχίο του Magister of Pharmacy (Mgr.) ή Doctor of Pharmacy (PharmDr.) αφού πέρασε μια πρόσθετη αυστηρή υπεράσπιση της διατριβής. Το δίπλωμα σλοβάκου φαρμακοποιού είναι διεθνώς αναγνωρισμένο σε όλες τις χώρες της Ευρωπαϊκής Ένωσης και σε πολλά άλλα κράτη.

Graduates are qualified for the post-doctoral study and are competent to work in the following areas: small animals clinics, large animals clinics, exotic animals clinics and ZOOs, game reserves, food safety and quality, pharmaceutical industry, research and development, teaching and consultancy, ecology